Biyoenerjetik kullanılan birimleri ve boyutları bir tartışma için tıklayınız.

Phosophlipid membranlar

 

Klaus Schulten en laboratuvarsıvı kristal halde bir phosopholipid membran bir model .

Proton iletim , proton kanalları , proton kuyu

 

Su nedeniyle su fizyolojik aralığında , sıvı özellikleri vermek su molekülleri ( bir moleküler dinamik simülasyon su yapısı güzel bir görünüm için gramicidin öğretici bakınız) , arasındaki H -bağlı ağların , proton iyi bir iletkendir . Buz ,H -bağlı ağları daha kapsamlıdır , ve buz sıvı su daha iyi bir iletkendir . İletim bir " hop - dönüş " mekanizması , ilk Grotthuss tarafından önerilen ve genellikleGrotthuss mekanizması olarak adlandırılan ile oluşur:

 

Mekanizması , bitişik bir grup (I , sağ) için H -bağlı zincirin ucundan bir proton ilk şerbetçiotu" hop" bölümünde , H - bağ gücü devri sonra da bir H tarafından değiştirilmesi + bağlayıcı sağlar diğer ucu , II yapısı elde edilir. " Dönüş" fazı ise, II 'de gösterildiği gibi suların dönme sonra başlangıç ​​yapı ( I)' in geri yükler. Bu H -bağlı zincir olarak,su ilke olarak H-bağı potansiyeli ile uygun bir protein yan zincirleri ile ikame edilebilir.

 

Su genellikle yüzeylerde sipariş ve yüzeyde iletim enerji bağlantı içindeproton akımı için tercih edilen bir yol olabileceğini öne sürülmüştür . Bununla birlikte, bir iletken yoluniletkenlikspesifik iletkenliği ve enine kesit alanının bir ürünü olduğu göz önüne alınmalıdır , çoğu durumda ,toplu sulu faz herhangi bir iletim yolu içinde daha büyük bir enine kesit alanına sahiptir yüzeyinden daha , ve bu nedenle daha olası iletken olur.

 

Kinonlipid aşamasındansitesine ulaşmak için çünkü oksidasyon veya Kinonların azaltılması içeren redoks reaksiyonlarda , protonların serbest veya alınır hangi siteleri sık sık ,protein gömülüdür. Proton pompa içeren başka protolytic reaksiyonlarda, proton bağlı veya serbest bırakılır hangisiteleri genellikle protein içine gömülür , vektörel çalışma proton yapılır hangimerkezine nispeten hareketsiz ve bu protein ile geçiş yollarına gerektirir. Her iki durumda da , proteinin protonları için iletim yolu bağlanan su moleküllerinin ve protein yan zincirlerinin bir zincir tarafından oluşan kanallar dahil olduğu düşünülmektedir. Böyle bir kanal , ve nasıl yukarıdaki modeli ( Nagle ve Tristram - Nagle den , 1983) , çizgisinde faaliyet olabilir genel bir resim aşağıda verilmiştir :