YGS-LYS, Konu Anlatımı

Proton kanalları ve proton kuyu

 Proton kanalları ve proton kuyu

En iyi çalışılmış proton kanal gramicidin ki, burada bir Zil öğretici gösterilen olmasıdır . Yapısal özellikleri gösteren bir serbest çalışan öğretici için tıklayınız. Eric Jakobsson bir membran - gramisidin modelinde bir molekül dinamiğigramisidin kanalda suları simüle sahiptir.
 
Böyle bir kanalın diğer güzel örneklerin her ikisi de RBbakteriyel reaksiyon merkezleri tespit edilmiştir. sphaeroides ve Rps . viridis ; Resimde H + -bağlanma kinon azaltılması husule geldiğisulu fazaQB- sitesindekinol bağlayan su kanalı taşımaktadır.
 
 
, Ve suları tarafındankinol yeşil bir top - ve - sopa yapı olarak , bir tel kafes yapısı ( ,, M - alt birimi , açık mavi - yeşil H - alt birimi , sarı - yeşil L - alt birimi , koyu mavi ) olarak protein gösterilir O- atomun pozisyonunda kırmızı küreler spacefilling . Dış orta sol üst kısmındaki boş hacim erişimi vardır . Daha kapsamlı bir tartışma ve bir Zil öğretici ile reaksiyon merkezinde su kanalı bakmak için tıklayınız .
Proton pompa Proton kanalları ve proton kuyu
 
Bu protonlar yüksek proton ( yukarıya bakınız ) için yapıyorlar özel yollar aracılığıyla katalitik sitelere erişmek olabilir mekanizmaları bir dizi önerilmiştir. Mitchell bu kanalları proton iletim yönünde ( Dpchannel = 0 ) boyunca herhangi önemli bir protonik potansiyel düşüş olmazdı işaret etti . Kanal yalıtım aşamasında doğru yarı geçer , ancak bu zarındanelektrik degrade ( Dy ) bir parçası yaşayacaksınız . Dpchannel = 0 olduğundan,kanal boyuncaelektrik degrade tersi bir kimyasal degrade ( - ZDpHchannel ) tarafından dengelenmelidir. Aşağıda gösterildiği gibi Mitchell ( Mitchell (1968 ) Kemoozmotik bağlantı ve enerji iletimi itibaren) , bu kanalları proton kuyu denir :
 
Proton kanalın iletkenliği yüksek bir sonuç mekanizması için önem taşımaktadır. Böyle bir kanalın bir proton pompa cihazının bir parçası olması isteniyorsa , o zaman herhangi bir çalışmaproton iletken kanal (lar) başka bir reaksiyon yolunun bir kısmı üzerinde yapılması gerekir (veya tarafından ) üzerinde yapıldı . Proton üzerinde çalışma yapmak için, ya da ligandedyolunun"aktif" kısmında birikir gerekir.
 
Proton "aktive edici " cihazlar ile bağlantılı proton kanalları da katılan prostetik gruplar sınırlı bir hareket sahip olduğu iki sistem de karakterize edilir. Çalışma proteinin yan zincirlerinin afinite değişikliklerebinükleer da redoks reaksiyonları birleştirilmesi ileproton gerçekleştirilir burada bu sistemlerden biri , sitokrom oksidaz . Michel ve arkadaşları CuB için histidin ligandlar içeren bir mekanizma ileri sürmüşlerdir. Diğerphotocycle mekanizmasıretinaldehidin -lisin oluşturduğuSchiff bazlıphotocycle sırasında deprotonasyonu ve protonasyon uğrar hangireaksiyonlar belirli modelleme ile , biraz detaylı olarak karakterize edilmiştir bakteriorodopsin vardır.